基因元件是控制基因轉(zhuǎn)錄與翻譯過(guò)程的生物分子及其對(duì)應(yīng)的DNA序列,如啟動(dòng)子、終止子、阻遏蛋白、轉(zhuǎn)錄激活序列、RNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)、重組酶等,在合成生物領(lǐng)域是基礎(chǔ)也是核心。合成生物學(xué)元件的標(biāo)準(zhǔn)化能夠?yàn)榛蚓€路構(gòu)建、DNA組裝提供極大的便利,而實(shí)現(xiàn)合成生物學(xué)元件標(biāo)準(zhǔn)化的目標(biāo)十分關(guān)鍵的一個(gè)問(wèn)題便是元件的管理,包括元件的構(gòu)建、儲(chǔ)存和共享。
元件庫(kù)作為基礎(chǔ)生物數(shù)據(jù)庫(kù),提供對(duì)功能元件統(tǒng)一的準(zhǔn)確信息記錄、分類管理、快速查找的數(shù)據(jù)靈活存儲(chǔ)方案。融入了元件識(shí)別工具,通過(guò)提供安全訪問(wèn)接口實(shí)現(xiàn)獲取元件信息的功能。支持將元件正式發(fā)布共享到元件庫(kù)公共數(shù)據(jù)集進(jìn)行公開(kāi)查閱,從多個(gè)來(lái)源( NCBI、ENSEMBL、Addgene 、IGEM和 JBEI等)搜索可公開(kāi)訪問(wèn)的元件信息,同時(shí)本元件庫(kù)將與平臺(tái)物理元件的樣品庫(kù)建立通信,支持元件分發(fā)、接受用戶實(shí)體元件的保藏分享。通過(guò)完善的資源收集、分類管理,打造高效有序的元件資源共享平臺(tái),滿足用戶需求。
1、通過(guò)使用元件庫(kù)可以改變以往元件數(shù)據(jù)存于散亂的現(xiàn)狀,輕松構(gòu)建豐富的生物基因元件庫(kù),并根據(jù)實(shí)際應(yīng)用對(duì)元件進(jìn)行模塊化、標(biāo)準(zhǔn)化的分類存儲(chǔ)與追溯。
2、元件庫(kù)的模塊化存儲(chǔ)和團(tuán)隊(duì)協(xié)作共享功能,能更大程度為實(shí)驗(yàn)過(guò)程賦能。
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